Žuželke:
- Čebulni črv (Delia antiqua)
- Resarji (Thrips tabaci)
- Čebulna muha (Eumerus spp.)
- Kosice (Agrotis spp.)
- Listne uši (Aphis spp.)
glive:
- Bela gniloba (Sclerotium cepivorum)
- Peronospora (Peronospora destructor)
- Rožnati koren (Phoma terrestris)
- Fusarium bazalna gniloba (Fusarium oxysporum f. sp. cepae)
Virusi:
- Virus rumene pritlikavosti čebule (OYDV)
- Virus rumene pege šarenice (IYSV)
- Virus čebulnega mozaika (OMV)
- Virus tobačnega klopotca (TRV)
Drugi škodljivci:
Treba je omeniti, da se lahko resnost in vpliv teh škodljivcev razlikujeta glede na določeno regijo in podnebje ter uporabljene prakse gojenja.